Protein–RNA interactions for Protein: Q494U1

PLEKHN1, Pleckstrin homology domain-containing family N member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHN1Q494U1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PLEKHN1Q494U1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLEKHN1Q494U1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.27■■□□□ 1
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