Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00303Q3SY05 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LINC00303Q3SY05 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00303Q3SY05 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms