Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UVSSAQ2YD98 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UVSSAQ2YD98 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UVSSAQ2YD98 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
UVSSAQ2YD98 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms