Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPN21Q16825 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms