Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLPPQ16740 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPPQ16740 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPPQ16740 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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