Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNF239Q16600 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF239Q16600 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF239Q16600 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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