Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMA4Q16363 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LAMA4Q16363 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
LAMA4Q16363 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA4Q16363 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LAMA4Q16363 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LAMA4Q16363 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LAMA4Q16363 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA4Q16363 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA4Q16363 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA4Q16363 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA4Q16363 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA4Q16363 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA4Q16363 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA4Q16363 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA4Q16363 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA4Q16363 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LAMA4Q16363 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMA4Q16363 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMA4Q16363 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMA4Q16363 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LAMA4Q16363 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LAMA4Q16363 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMA4Q16363 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMA4Q16363 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMA4Q16363 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LAMA4Q16363 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMA4Q16363 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMA4Q16363 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMA4Q16363 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMA4Q16363 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMA4Q16363 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LAMA4Q16363 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LAMA4Q16363 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA4Q16363 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA4Q16363 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA4Q16363 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA4Q16363 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA4Q16363 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA4Q16363 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LAMA4Q16363 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMA4Q16363 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LAMA4Q16363 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMA4Q16363 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LAMA4Q16363 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMA4Q16363 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMA4Q16363 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMA4Q16363 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LAMA4Q16363 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA4Q16363 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LAMA4Q16363 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
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