Protein–RNA interactions for Protein: Q15583

TGIF1, Homeobox protein TGIF1, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1Q15583 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TGIF1Q15583 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TGIF1Q15583 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms