Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CNN3Q15417 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CNN3Q15417 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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