Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX17Q15036 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SNX17Q15036 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNX17Q15036 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
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