Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SHPRHQ149N8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SHPRHQ149N8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SHPRHQ149N8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
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