Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CDK13Q14004 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CDK13Q14004 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CDK13Q14004 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CDK13Q14004 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
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