Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNTA1Q13424 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTA1Q13424 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNTA1Q13424 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNTA1Q13424 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNTA1Q13424 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNTA1Q13424 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNTA1Q13424 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNTA1Q13424 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNTA1Q13424 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNTA1Q13424 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNTA1Q13424 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNTA1Q13424 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNTA1Q13424 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNTA1Q13424 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNTA1Q13424 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNTA1Q13424 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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