Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRSF6Q13247 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SRSF6Q13247 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF6Q13247 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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