Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUDPQ08623 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUDPQ08623 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms