Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TFF3Q07654 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TFF3Q07654 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TFF3Q07654 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms