Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDK18Q07002 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK18Q07002 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK18Q07002 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms