Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DSG1Q02413 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DSG1Q02413 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DSG1Q02413 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DSG1Q02413 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms