Protein–RNA interactions for Protein: P98077

SHC2, SHC-transforming protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC2P98077 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHC2P98077 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHC2P98077 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHC2P98077 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHC2P98077 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHC2P98077 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHC2P98077 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHC2P98077 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHC2P98077 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHC2P98077 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHC2P98077 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHC2P98077 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHC2P98077 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHC2P98077 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHC2P98077 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHC2P98077 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHC2P98077 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHC2P98077 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC2P98077 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC2P98077 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC2P98077 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC2P98077 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC2P98077 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC2P98077 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC2P98077 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC2P98077 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC2P98077 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC2P98077 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC2P98077 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC2P98077 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC2P98077 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC2P98077 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC2P98077 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC2P98077 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC2P98077 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC2P98077 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC2P98077 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC2P98077 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC2P98077 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC2P98077 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC2P98077 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC2P98077 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC2P98077 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC2P98077 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC2P98077 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC2P98077 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHC2P98077 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC2P98077 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC2P98077 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC2P98077 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC2P98077 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC2P98077 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC2P98077 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC2P98077 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC2P98077 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC2P98077 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC2P98077 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC2P98077 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC2P98077 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC2P98077 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC2P98077 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC2P98077 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC2P98077 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC2P98077 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC2P98077 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC2P98077 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC2P98077 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC2P98077 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC2P98077 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC2P98077 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC2P98077 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC2P98077 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC2P98077 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC2P98077 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC2P98077 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC2P98077 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC2P98077 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC2P98077 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC2P98077 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC2P98077 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC2P98077 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC2P98077 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC2P98077 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC2P98077 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC2P98077 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC2P98077 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC2P98077 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC2P98077 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC2P98077 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC2P98077 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC2P98077 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC2P98077 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC2P98077 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC2P98077 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC2P98077 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC2P98077 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC2P98077 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC2P98077 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC2P98077 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC2P98077 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms