Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTA1P68133 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTA1P68133 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTA1P68133 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTA1P68133 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTA1P68133 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ACTA1P68133 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTA1P68133 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms