Protein–RNA interactions for Protein: P63136

ERVK-25, Endogenous retrovirus group K member 25 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-25P63136 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-25P63136 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-25P63136 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-25P63136 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-25P63136 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-25P63136 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-25P63136 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVK-25P63136 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVK-25P63136 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ERVK-25P63136 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-25P63136 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-25P63136 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms