Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVFC1P60507 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVFC1P60507 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVFC1P60507 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVFC1P60507 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms