Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA9P57773 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA9P57773 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJA9P57773 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GJA9P57773 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA9P57773 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA9P57773 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA9P57773 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA9P57773 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA9P57773 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA9P57773 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA9P57773 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA9P57773 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJA9P57773 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA9P57773 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA9P57773 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA9P57773 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA9P57773 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJA9P57773 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA9P57773 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA9P57773 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA9P57773 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA9P57773 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA9P57773 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA9P57773 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA9P57773 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJA9P57773 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA9P57773 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA9P57773 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA9P57773 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA9P57773 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA9P57773 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA9P57773 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA9P57773 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA9P57773 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJA9P57773 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA9P57773 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA9P57773 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA9P57773 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA9P57773 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA9P57773 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA9P57773 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJA9P57773 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA9P57773 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA9P57773 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA9P57773 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA9P57773 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJA9P57773 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJA9P57773 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJA9P57773 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJA9P57773 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GJA9P57773 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJA9P57773 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJA9P57773 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJA9P57773 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GJA9P57773 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GJA9P57773 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GJA9P57773 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GJA9P57773 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJA9P57773 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJA9P57773 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJA9P57773 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJA9P57773 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJA9P57773 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJA9P57773 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJA9P57773 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA9P57773 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA9P57773 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA9P57773 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA9P57773 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA9P57773 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA9P57773 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA9P57773 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA9P57773 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA9P57773 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA9P57773 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA9P57773 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA9P57773 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJA9P57773 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJA9P57773 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJA9P57773 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJA9P57773 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJA9P57773 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJA9P57773 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GJA9P57773 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJA9P57773 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJA9P57773 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJA9P57773 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJA9P57773 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJA9P57773 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJA9P57773 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GJA9P57773 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJA9P57773 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJA9P57773 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJA9P57773 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GJA9P57773 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJA9P57773 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJA9P57773 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJA9P57773 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJA9P57773 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms