Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC8A3P57103 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC8A3P57103 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC8A3P57103 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms