Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRG3P56975 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRG3P56975 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NRG3P56975 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRG3P56975 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRG3P56975 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NRG3P56975 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRG3P56975 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRG3P56975 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRG3P56975 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRG3P56975 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRG3P56975 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRG3P56975 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRG3P56975 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRG3P56975 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NRG3P56975 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRG3P56975 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NRG3P56975 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRG3P56975 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRG3P56975 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRG3P56975 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NRG3P56975 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRG3P56975 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRG3P56975 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRG3P56975 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRG3P56975 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRG3P56975 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NRG3P56975 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRG3P56975 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRG3P56975 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRG3P56975 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRG3P56975 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRG3P56975 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NRG3P56975 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NRG3P56975 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRG3P56975 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRG3P56975 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRG3P56975 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NRG3P56975 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRG3P56975 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRG3P56975 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRG3P56975 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRG3P56975 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRG3P56975 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NRG3P56975 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRG3P56975 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRG3P56975 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRG3P56975 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRG3P56975 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NRG3P56975 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRG3P56975 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRG3P56975 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRG3P56975 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRG3P56975 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NRG3P56975 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRG3P56975 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRG3P56975 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRG3P56975 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRG3P56975 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRG3P56975 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRG3P56975 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRG3P56975 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRG3P56975 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRG3P56975 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NRG3P56975 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRG3P56975 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRG3P56975 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRG3P56975 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRG3P56975 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRG3P56975 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NRG3P56975 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRG3P56975 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRG3P56975 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRG3P56975 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRG3P56975 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRG3P56975 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NRG3P56975 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRG3P56975 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRG3P56975 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRG3P56975 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRG3P56975 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NRG3P56975 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NRG3P56975 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRG3P56975 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRG3P56975 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRG3P56975 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRG3P56975 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRG3P56975 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRG3P56975 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRG3P56975 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRG3P56975 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRG3P56975 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRG3P56975 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRG3P56975 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRG3P56975 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRG3P56975 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRG3P56975 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRG3P56975 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRG3P56975 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRG3P56975 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms