Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH15P55291 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH15P55291 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH15P55291 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH15P55291 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH15P55291 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH15P55291 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH15P55291 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH15P55291 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH15P55291 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH15P55291 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH15P55291 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH15P55291 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH15P55291 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH15P55291 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH15P55291 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH15P55291 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH15P55291 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH15P55291 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDH15P55291 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDH15P55291 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH15P55291 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH15P55291 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH15P55291 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH15P55291 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH15P55291 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH15P55291 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH15P55291 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH15P55291 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH15P55291 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH15P55291 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH15P55291 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH15P55291 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH15P55291 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH15P55291 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH15P55291 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH15P55291 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH15P55291 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH15P55291 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH15P55291 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH15P55291 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH15P55291 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH15P55291 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH15P55291 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH15P55291 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH15P55291 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDH15P55291 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH15P55291 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH15P55291 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH15P55291 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH15P55291 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH15P55291 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH15P55291 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDH15P55291 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH15P55291 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH15P55291 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH15P55291 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH15P55291 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH15P55291 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH15P55291 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH15P55291 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH15P55291 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDH15P55291 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH15P55291 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH15P55291 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH15P55291 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH15P55291 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH15P55291 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH15P55291 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH15P55291 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH15P55291 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH15P55291 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH15P55291 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH15P55291 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH15P55291 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH15P55291 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH15P55291 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH15P55291 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH15P55291 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH15P55291 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH15P55291 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH15P55291 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH15P55291 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH15P55291 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.5 ms