Protein–RNA interactions for Protein: P55083

MFAP4, Microfibril-associated glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP4P55083 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MFAP4P55083 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MFAP4P55083 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms