Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE6CP51160 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDE6CP51160 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDE6CP51160 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms