Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARCN1P48444 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARCN1P48444 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms