Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RXRGP48443 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RXRGP48443 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RXRGP48443 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RXRGP48443 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RXRGP48443 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RXRGP48443 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RXRGP48443 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RXRGP48443 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RXRGP48443 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RXRGP48443 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RXRGP48443 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RXRGP48443 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RXRGP48443 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RXRGP48443 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RXRGP48443 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RXRGP48443 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RXRGP48443 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RXRGP48443 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RXRGP48443 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RXRGP48443 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RXRGP48443 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RXRGP48443 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RXRGP48443 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RXRGP48443 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RXRGP48443 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RXRGP48443 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXRGP48443 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXRGP48443 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXRGP48443 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXRGP48443 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXRGP48443 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXRGP48443 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXRGP48443 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXRGP48443 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXRGP48443 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXRGP48443 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXRGP48443 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXRGP48443 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXRGP48443 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXRGP48443 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXRGP48443 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXRGP48443 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXRGP48443 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXRGP48443 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXRGP48443 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXRGP48443 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXRGP48443 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RXRGP48443 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RXRGP48443 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RXRGP48443 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RXRGP48443 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RXRGP48443 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RXRGP48443 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RXRGP48443 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RXRGP48443 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXRGP48443 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXRGP48443 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXRGP48443 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXRGP48443 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXRGP48443 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXRGP48443 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXRGP48443 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXRGP48443 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXRGP48443 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXRGP48443 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXRGP48443 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXRGP48443 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXRGP48443 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXRGP48443 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXRGP48443 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXRGP48443 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RXRGP48443 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RXRGP48443 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RXRGP48443 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RXRGP48443 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RXRGP48443 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RXRGP48443 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RXRGP48443 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RXRGP48443 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RXRGP48443 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RXRGP48443 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RXRGP48443 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RXRGP48443 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms