Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACADSBP45954 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms