Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL13AP40429 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL13AP40429 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms