Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL3P39023 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPL3P39023 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL3P39023 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL3P39023 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL3P39023 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL3P39023 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL3P39023 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3P39023 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3P39023 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3P39023 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3P39023 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3P39023 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3P39023 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3P39023 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3P39023 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3P39023 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3P39023 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3P39023 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3P39023 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL3P39023 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL3P39023 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL3P39023 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL3P39023 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3P39023 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3P39023 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3P39023 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3P39023 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3P39023 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3P39023 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3P39023 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3P39023 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL3P39023 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL3P39023 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL3P39023 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL3P39023 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL3P39023 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL3P39023 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL3P39023 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL3P39023 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL3P39023 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL3P39023 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL3P39023 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL3P39023 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL3P39023 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL3P39023 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL3P39023 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL3P39023 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL3P39023 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL3P39023 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL3P39023 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL3P39023 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL3P39023 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL3P39023 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL3P39023 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL3P39023 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL3P39023 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL3P39023 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL3P39023 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL3P39023 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL3P39023 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL3P39023 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL3P39023 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL3P39023 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL3P39023 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL3P39023 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL3P39023 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL3P39023 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL3P39023 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL3P39023 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL3P39023 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL3P39023 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL3P39023 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL3P39023 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL3P39023 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL3P39023 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL3P39023 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL3P39023 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL3P39023 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL3P39023 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL3P39023 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL3P39023 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL3P39023 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL3P39023 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL3P39023 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL3P39023 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL3P39023 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL3P39023 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL3P39023 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL3P39023 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL3P39023 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL3P39023 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL3P39023 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL3P39023 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL3P39023 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL3P39023 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL3P39023 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL3P39023 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL3P39023 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL3P39023 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms