Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCAP37840 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCAP37840 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNCAP37840 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCAP37840 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCAP37840 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCAP37840 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCAP37840 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCAP37840 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNCAP37840 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCAP37840 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCAP37840 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCAP37840 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCAP37840 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCAP37840 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCAP37840 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNCAP37840 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCAP37840 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCAP37840 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCAP37840 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCAP37840 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCAP37840 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCAP37840 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNCAP37840 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCAP37840 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCAP37840 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCAP37840 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCAP37840 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCAP37840 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCAP37840 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCAP37840 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCAP37840 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNCAP37840 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCAP37840 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCAP37840 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCAP37840 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCAP37840 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCAP37840 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNCAP37840 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCAP37840 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCAP37840 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCAP37840 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCAP37840 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCAP37840 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCAP37840 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCAP37840 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCAP37840 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCAP37840 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCAP37840 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNCAP37840 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCAP37840 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCAP37840 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCAP37840 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCAP37840 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCAP37840 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCAP37840 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCAP37840 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCAP37840 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCAP37840 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCAP37840 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCAP37840 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCAP37840 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCAP37840 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNCAP37840 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCAP37840 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCAP37840 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCAP37840 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCAP37840 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCAP37840 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCAP37840 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCAP37840 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCAP37840 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCAP37840 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCAP37840 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCAP37840 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCAP37840 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNCAP37840 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNCAP37840 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNCAP37840 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCAP37840 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCAP37840 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCAP37840 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCAP37840 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCAP37840 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNCAP37840 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCAP37840 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCAP37840 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCAP37840 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCAP37840 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCAP37840 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCAP37840 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCAP37840 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCAP37840 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCAP37840 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCAP37840 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCAP37840 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNCAP37840 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNCAP37840 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNCAP37840 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNCAP37840 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms