Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THBS4P35443 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THBS4P35443 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THBS4P35443 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THBS4P35443 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THBS4P35443 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
THBS4P35443 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THBS4P35443 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THBS4P35443 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THBS4P35443 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
THBS4P35443 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
THBS4P35443 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THBS4P35443 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THBS4P35443 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THBS4P35443 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THBS4P35443 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
THBS4P35443 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THBS4P35443 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THBS4P35443 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THBS4P35443 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
THBS4P35443 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THBS4P35443 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THBS4P35443 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THBS4P35443 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
THBS4P35443 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
THBS4P35443 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THBS4P35443 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THBS4P35443 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THBS4P35443 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
THBS4P35443 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THBS4P35443 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THBS4P35443 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THBS4P35443 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
THBS4P35443 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
THBS4P35443 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
THBS4P35443 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
THBS4P35443 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
THBS4P35443 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
THBS4P35443 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
THBS4P35443 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
THBS4P35443 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
THBS4P35443 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
THBS4P35443 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
THBS4P35443 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
THBS4P35443 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
THBS4P35443 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
THBS4P35443 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
THBS4P35443 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
THBS4P35443 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
THBS4P35443 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
THBS4P35443 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
THBS4P35443 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
THBS4P35443 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
THBS4P35443 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
THBS4P35443 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
THBS4P35443 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
THBS4P35443 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
THBS4P35443 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
THBS4P35443 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
THBS4P35443 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
THBS4P35443 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
THBS4P35443 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
THBS4P35443 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
THBS4P35443 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
THBS4P35443 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
THBS4P35443 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
THBS4P35443 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
THBS4P35443 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
THBS4P35443 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
THBS4P35443 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
THBS4P35443 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
THBS4P35443 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
THBS4P35443 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
THBS4P35443 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
THBS4P35443 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
THBS4P35443 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
THBS4P35443 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
THBS4P35443 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
THBS4P35443 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
THBS4P35443 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
THBS4P35443 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
THBS4P35443 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
THBS4P35443 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
THBS4P35443 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
THBS4P35443 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
THBS4P35443 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
THBS4P35443 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
THBS4P35443 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
THBS4P35443 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
THBS4P35443 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
THBS4P35443 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
THBS4P35443 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
THBS4P35443 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
THBS4P35443 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
THBS4P35443 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
THBS4P35443 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
THBS4P35443 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
THBS4P35443 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
THBS4P35443 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
THBS4P35443 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms