Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP1P32455 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP1P32455 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP1P32455 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP1P32455 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP1P32455 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP1P32455 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP1P32455 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP1P32455 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP1P32455 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP1P32455 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP1P32455 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP1P32455 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP1P32455 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP1P32455 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP1P32455 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP1P32455 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP1P32455 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP1P32455 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP1P32455 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP1P32455 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP1P32455 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP1P32455 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP1P32455 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP1P32455 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP1P32455 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP1P32455 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP1P32455 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP1P32455 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP1P32455 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP1P32455 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP1P32455 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP1P32455 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP1P32455 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP1P32455 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP1P32455 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP1P32455 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP1P32455 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP1P32455 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP1P32455 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP1P32455 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP1P32455 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP1P32455 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP1P32455 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP1P32455 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP1P32455 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP1P32455 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP1P32455 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP1P32455 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP1P32455 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP1P32455 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GBP1P32455 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP1P32455 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GBP1P32455 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP1P32455 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP1P32455 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP1P32455 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP1P32455 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP1P32455 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP1P32455 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP1P32455 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP1P32455 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GBP1P32455 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP1P32455 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP1P32455 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP1P32455 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP1P32455 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP1P32455 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP1P32455 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP1P32455 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP1P32455 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP1P32455 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP1P32455 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GBP1P32455 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP1P32455 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP1P32455 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP1P32455 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP1P32455 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP1P32455 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GBP1P32455 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP1P32455 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP1P32455 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP1P32455 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP1P32455 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GBP1P32455 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP1P32455 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP1P32455 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP1P32455 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP1P32455 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP1P32455 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP1P32455 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP1P32455 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP1P32455 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP1P32455 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP1P32455 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP1P32455 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP1P32455 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP1P32455 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP1P32455 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP1P32455 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms