Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD40LGP29965 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CD40LGP29965 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD40LGP29965 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms