Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU1F1P28069 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU1F1P28069 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU1F1P28069 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POU1F1P28069 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU1F1P28069 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POU1F1P28069 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU1F1P28069 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU1F1P28069 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POU1F1P28069 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POU1F1P28069 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU1F1P28069 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU1F1P28069 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU1F1P28069 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU1F1P28069 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
POU1F1P28069 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POU1F1P28069 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms