Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA3P26006 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA3P26006 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA3P26006 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms