Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTAFRP25105 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms