Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTNP21246 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTNP21246 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTNP21246 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTNP21246 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTNP21246 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTNP21246 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTNP21246 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTNP21246 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTNP21246 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PTNP21246 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTNP21246 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTNP21246 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTNP21246 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTNP21246 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTNP21246 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTNP21246 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTNP21246 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTNP21246 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTNP21246 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTNP21246 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTNP21246 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTNP21246 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTNP21246 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTNP21246 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTNP21246 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTNP21246 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTNP21246 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTNP21246 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTNP21246 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTNP21246 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTNP21246 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTNP21246 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTNP21246 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTNP21246 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTNP21246 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTNP21246 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTNP21246 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTNP21246 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTNP21246 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTNP21246 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTNP21246 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTNP21246 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTNP21246 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTNP21246 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTNP21246 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTNP21246 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTNP21246 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTNP21246 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTNP21246 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTNP21246 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTNP21246 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTNP21246 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTNP21246 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTNP21246 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTNP21246 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTNP21246 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTNP21246 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTNP21246 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTNP21246 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTNP21246 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTNP21246 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTNP21246 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTNP21246 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTNP21246 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTNP21246 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTNP21246 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTNP21246 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTNP21246 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTNP21246 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTNP21246 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTNP21246 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTNP21246 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTNP21246 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTNP21246 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTNP21246 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTNP21246 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTNP21246 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTNP21246 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTNP21246 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTNP21246 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms