Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB3AP20336 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB3AP20336 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB3AP20336 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms