Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNNI1P19237 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNNI1P19237 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNNI1P19237 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms