Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DESP17661 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DESP17661 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DESP17661 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DESP17661 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DESP17661 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DESP17661 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DESP17661 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DESP17661 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DESP17661 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DESP17661 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DESP17661 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DESP17661 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DESP17661 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DESP17661 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DESP17661 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DESP17661 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DESP17661 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DESP17661 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DESP17661 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DESP17661 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DESP17661 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DESP17661 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DESP17661 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DESP17661 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DESP17661 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DESP17661 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DESP17661 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DESP17661 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DESP17661 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DESP17661 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DESP17661 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DESP17661 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DESP17661 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DESP17661 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESP17661 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESP17661 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESP17661 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESP17661 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESP17661 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESP17661 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESP17661 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESP17661 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESP17661 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESP17661 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DESP17661 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DESP17661 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DESP17661 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DESP17661 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DESP17661 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DESP17661 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DESP17661 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DESP17661 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DESP17661 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DESP17661 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DESP17661 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DESP17661 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DESP17661 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DESP17661 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DESP17661 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DESP17661 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DESP17661 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DESP17661 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DESP17661 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DESP17661 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DESP17661 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DESP17661 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DESP17661 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DESP17661 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DESP17661 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DESP17661 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DESP17661 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DESP17661 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DESP17661 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DESP17661 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DESP17661 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DESP17661 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DESP17661 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DESP17661 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DESP17661 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DESP17661 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DESP17661 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DESP17661 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DESP17661 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DESP17661 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DESP17661 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DESP17661 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DESP17661 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DESP17661 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DESP17661 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DESP17661 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DESP17661 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DESP17661 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DESP17661 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DESP17661 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DESP17661 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DESP17661 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DESP17661 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DESP17661 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DESP17661 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms