Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN2P17655 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CAPN2P17655 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN2P17655 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms