Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCL3L1P16619 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCL3L1P16619 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCL3L1P16619 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms