Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MYOD1P15172 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms