Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8BP10966 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8BP10966 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD8BP10966 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD8BP10966 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD8BP10966 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8BP10966 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8BP10966 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8BP10966 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8BP10966 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8BP10966 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8BP10966 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8BP10966 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8BP10966 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8BP10966 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8BP10966 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8BP10966 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD8BP10966 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD8BP10966 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD8BP10966 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD8BP10966 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD8BP10966 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD8BP10966 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD8BP10966 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD8BP10966 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD8BP10966 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD8BP10966 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD8BP10966 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD8BP10966 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD8BP10966 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD8BP10966 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD8BP10966 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8BP10966 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8BP10966 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8BP10966 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8BP10966 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8BP10966 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8BP10966 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8BP10966 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8BP10966 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8BP10966 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8BP10966 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8BP10966 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD8BP10966 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8BP10966 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8BP10966 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8BP10966 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8BP10966 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8BP10966 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8BP10966 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8BP10966 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8BP10966 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8BP10966 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8BP10966 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8BP10966 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8BP10966 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8BP10966 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD8BP10966 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD8BP10966 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD8BP10966 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD8BP10966 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD8BP10966 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD8BP10966 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD8BP10966 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD8BP10966 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD8BP10966 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD8BP10966 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD8BP10966 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD8BP10966 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD8BP10966 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD8BP10966 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD8BP10966 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD8BP10966 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD8BP10966 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD8BP10966 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD8BP10966 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD8BP10966 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD8BP10966 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD8BP10966 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD8BP10966 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD8BP10966 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD8BP10966 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD8BP10966 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD8BP10966 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD8BP10966 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD8BP10966 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD8BP10966 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD8BP10966 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD8BP10966 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD8BP10966 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD8BP10966 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD8BP10966 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD8BP10966 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD8BP10966 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD8BP10966 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD8BP10966 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD8BP10966 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD8BP10966 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD8BP10966 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CD8BP10966 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.6 ms