Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM225BP0DP42 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM225BP0DP42 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM225BP0DP42 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms