Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf89P0DMQ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C8orf89P0DMQ9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms